Pod względem wizualnym KTM 990 Duke R 2025 przypomina swoich poprzedników, z jednej strony bezpośrednią poprzedniczkę KTM 890 Duke R, z drugiej zaś szczególnie pod względem kolorystyki i pomarańczowych akcentów nawiązuje do modeli drugiej generacji 990 SUPER Duke R (2011-2013). Charakterystyczny design uzupełnia błyszcząca, proszkowo malowana rama w kolorze "Electronic Orange", białe listwy ozdobne i matowoczarne detale. Prawie tak wyraźne jak u większej siostry, KTM 1390 Super Duke R, dumnie widnieje w czarno-pomarańczowej tonacji duże „R” na zbiorniku. Osłona siedzenia pasażera jest standardem, a osoby, które chcą wyposażyć 990 Duke R, która oczywiście jest dopuszczona do jazdy z pasażerem, w siedzenie dla pasażera (i odpowiadające im podnóżki) muszą zajrzeć do PowerParts. Pomarańczowe felgi również zostały zapożyczone z modelu 1390 i dopełniają design motocykla.
Wysokość siedzenia i prześwit w wersji R wzrastają o 15 mm do odpowiednio 840 i 210 mm, według KTM zwiększa to przechył o 3 stopnie w porównaniu do standardowej wersji 990 Duke R.

&width=72&height=72&bgcolor=rgba_39_42_44_0&mode=crop)












